Classificacion filogenetica : Diferéncia entre versions

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Vèire [[taxinomia]].
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! bgcolor="e0d0b0" | [[Classificacion filogenetica]]
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| '''Domèni''': || '''[[Archaea]]'''
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| '''Domèni''': || '''[[Euryarchaeota]]'''
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| '''Domèni''': || '''[[Eukaryota]]'''
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! bgcolor="e0d0b0" | [[Rènhe]]
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| bgcolor="pink" | [[Rènhe animal|Animal]]ia
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| bgcolor="lightblue" | [[Champignon|Fungi]]
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| bgcolor="lightgreen" | [[plante|Plantae]]
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La '''classificacion filogenetica''' es un sistèma de classificacion [[systématique]] des êtres vivants. Elle remplace la [[classificacion scientifique|classificacion traditionnelle]] basée sur des traits phénotypiques e des préférences nutritionnelles. Une des grandes évolutions de l'approche filogenica es que cette classificacion bouleverse les classificacions fixistes comme celle développées per [[Linné]]. La classificacion binomiale de Linné était basée sur l'adage que toutes les espècias sont apparues en même temps e que celles-ci étaient fixes. Alors que la classificacion filogenetica illustre les principes d'évolutions e de parenté des espècias.
 
 
== Présentation ==
 
La classificacion filogenetica fut initiée per Willi Hennig en 1950, qui révolutionna ensuite, après la traduction en anglais de son œuvre, toute la systématique a partir de la fin des années soixante. Les caractères anatomiques des êtres vivants furent alors analysés différemment, rejoints bientôt per les caractères moléculaires.
La classificacion filogenetica es un sistèma de classificacion des êtres vivants d'abord fondé sur ce que les êtres vivants ont (au niveau morphologique comme au niveau moléculaire), e non pas, en première instance, sur ce qu’ils n’ont pas (on évitera alors « invertébrés ») ou sur ce qu’ils font (on évitera alors « vivipares », « fouisseurs »). Ce n'es pas une classificacion écologique ni anthropocentrique. Elle regroupe les êtres vivants sur un type particulier de ressemblance, celles des ressemblances qui sont évolutivement innovantes au sein de l'échantillon d'espècias a classer. Elle s'oppose en cela aux classificacions phénétiques qui ne trient pas la ressemblance e font des classements a partir de la ressemblance globale. Elle remplace la classificacion traditionnelle basée sur une foule de critères, morphologiques mais aussi écologiques, éthologiques, anthropocentriques, e de préférences nutritionnelles.
 
La classificacion filogenetica ne valide que des groupes monophylétiques, quels que soient les caractères utilisés, moléculaires, morphologiques, anatomiques, caryologiques, génomiques. Les caractères utilisés per construire un arbre filogenetica n'es valable que si celui-ci es un caractère apomorphe partagé per au moins deux taxons. (Un caractère apomorphe es un caractère ancestral qui a été transformé. Ce caractère apomorphe partagé es une synapomorphie. Seul les synapomorphies (ou caractère dérivé) caractérise un clade ou groupe monophylétique. Un groupe monophylétique (ou clade) es un groupe comprenant un ancêtre (ou nœud) e tous ses descendants.
 
 
 
La première hiérarchie es donc composée de trois '''domaines''':
# [[Archaea|Archéobactérie]]s
# [[Euryarchaeota|Eubactérie]]s
# [[Eucaryote]]s
 
Savoir lesquels de ces trois groupes partagent un ancêtre commun qui les distingue du troisième es un sujet de recherche.
 
La systématique [[phylogénie|filogenetica]] dans sa version moderne rejette toute catégorisation des niveaux hiérarchiques. Per des raisons pratiques l'arbre du vivant donne lui-même la hiérarchie que tentaient de fournir les anciennes categorias. L'arbre du vivant es, en effet, un ensemble de points de branchement. Chaque niveau es assimilé a un taxon. Un taxon es un regroupement d'organisme définit per un ensemble de synapomorphies. Les points ou nœuds sont obligatoirement un organisme théorique qui possèderait les synapomorphies des nœuds postérieurs dans le cladogramme. Si cet organisme es découvert (fossiles ou autres) un nouvel arbre doit être construit.
A terme, si l'arbre restitue la totalité des relations de parenté, tous les branchements devraient être binaires. Le sens des dichotomies n'a rien a voir amb la sexualité ni amb des spéciations binaires, car l'arbre n'es pas une généalogie ("qui descend de qui"), mais reflète uniquement un pouvoir explicatif maximal de l'arbre : un arbre totalement dichotomique réussit a restituer toutes les relations de parenté ("qui es mai proche de qui").
 
La systématique moderne prend en compte tous les caractères héritables, depuis ce qui es visible (anatomie e morphologie, base de la classificacion traditionnelle) jusqu'aux séquences d'[[Acide désoxyribo-nucléique|ADN]] e d'[[Acide ribonucléique|ARN]], en passant per les [[protéine]]s e les données de la [[paléontologie]]. Le séquençage de certaines parties du [[génome]], comme l'[[Acide désoxyribo-nucléique|ADN]] des [[mitochondries]] ou l'[[Acide ribonucléique|ARN]] des [[ribosomes]] a permis dans les dernières années de faire des progrès importants dans la classificacion e de résoudre maints problèmes séculaires.
 
L'arbre es obtenu a partir de nombreux critères e fait appel a des algorithmes complexes. Des algorithmes différents peuvent donner des résultats différents. Dans ce cas celui qui répondra le mai aux critères de parcimonies sera retenu. C'es a dire l'arbre demandant le minimum de transformation de caractères.
La classificacion actuelle es continuellement remaniée en fonction de nouvelles informations.
Le siti [http://www.treebase.org/treebase/index.html treebase] fait référence. Les exemples qui suivent peuvent avoir a être modificats.
 
== Exèmple de l'Homme ==
 
Un exèmple détaillé permet d'avoir une idée de la différence de résultat, per rapport a l'approche traditionnelle. L'exèmple incontournable es celui de l'homme. Voici une partie des nœuds successifs permettant de classer l'homme (certains intermédiaires ont été omis arbitrairement) telle qu'apparaissant dans ''Classificacion filogenetica du vivant'' ([[Guillaume Lecointre]] e [[Hervé Le Guyader]], édition Belin) (la description associée a chaque clade es peu rigoureuse e vise juste a fixer les idées) :
 
* '''Espècia''' ''[[Homo sapiens]]''
* '''Genre''' ''[[Homo]]'' : inclut les espècias fossiles comme ''[[néanderthal]]'' ou ''[[Homo erectus|erectus]]''
* Hominines : les genres ''[[Australopithecus]]'' e ''Homo''
* Homininés : les deux espècias de chimpanzés e les hominines
* '''Famille''' [[Hominidés]] : gorille e Homininés
* Hominoïdés : on ajoute l'orang-outang
* Hominoïdes : on ajoute les gibbons
* Catarrhiniens : les singes de l'ancien monde
* Simiiformes : [[singe]]s
* Haplorrhiniens : singes e certains [[lémuriens]]
* '''Ordre''' [[Primate]]s (stricto sensu) : la mai grande partie de l'ancien ordre des primates
* [[Primate]]s (lato sensu) : s’ajustan les [[Scandentiens]] (toupayes)
* [[Archontes]] : s’ajustan les [[Chiroptère]]s (chauve-souris) e les [[Dermoptère]]s
* Preptothériens : s’ajustan la plupart des mammifères placentaires
* Euthériens : s’ajustan les pangolins e fourmiliers ([[Xénarthres]]) per compléter les mammifères placentaires
* Thériens : s’ajustan les marsupiaux
* '''Classe''' [[Mammifère]]s : l'ancienne classe du même nom, les précédents mai les [[monotrème]]s (ornithorhynques e échidnés)
* [[Amniote]]s : s’ajustan l'ancienne classe des reptiles e les oiseaux
* [[Tétrapode]]s : s’ajustan en gros les amphibiens
* [[Sarcoptérygien]]s : s’ajustan dipneustes puis coelacanthes
* [[Ostéichthyen]]s : s’ajustan les actinoptérygiens (la majeure partie des « poissons osseux »)
* '''[[Vertébré]]s''' : s’ajustan les requins puis les lamproies
* [[Craniates]] : s’ajustan les [[myxine]]s
* '''Embranchement''' [[Chordé]]s : s’ajustan amphioxus e ascidies
* [[Deutérostomien]]s : s’ajustan les échinodermes (étoiles de mer, oursins, ...)
* [[Bilatériens]] : animals symétriques : s’ajustan aux précédents, entre autres, les protostomiens qui incluent, entre beaucoup d'autres, différents groupes de vers, les arthropodes (insectes), les mollusques (escargots)
* [[Eumétazoaires]] : animals organisés, s’ajustan aux précédents les cnidaires per exèmple
* [[Métazoaires]] : l'ancien rènhe animal, s’ajustan aux précédents différents groupes d'éponges
 
* [[Opisthocontes]] : s’ajustan, entre autres, les champignons
* '''Domèni''' [[Eucaryote]]s : êtres vivants a cellules a noyau ; s’ajustan aux précédents listés ci-dessus la lignée verte (algues vertes, algues rouges, plantes a fleurs), la lignée brune (algues brunes, ...) e toute une collection de groupements d'espècias unicellulaires
 
== Différences amb l'ancien sistèma ==
 
Citons enfin quelques exemples de changements spectaculaires per rapport a la [[classificacion scientifique|classificacion traditionnelle]].
* Tous les ancêtres des [[dinosaure]]s sont aussi des ancêtres des [[oiseau]]x, ce qui amène a considérer ceux-ci comme les descendants d'un groupe de petits dinosaures volants vivants au [[crétacé]]. (Le concept de « reptile » es abandonné.)
:Précisons la relation entre oiseaux e dinosaures. Per certains auteurs, le [[vélociraptor]] es considéré comme mai proche des oiseaux que le [[tyrannosaure]], e ce dernier es considéré mai proche des oiseaux que du [[diplodocus]].
* Les mai proches parents des [[cétacé]]s seraient les hippopotames. (Le concept d'"artiodactyles" es abandonné.)
* Les mai proches parents vivants des oiseaux sont les [[crocodile]]s.
* Les poissons osseux sont mai proches des mammifères que des [[requin]]s. (Le concept de « poisson » es abandonné.)
* L'ancien groupe des « [[algue]]s » explose en tous sens, certaines étant groupées amb les [[plante|plantes vertes]], d'autres amb les [[bactérie]]s.
* Le concept de « protiste » es abandonné, au profit de groupes pouvant mélanger êtres multicellulaires e monocellulaires (per exèmple les straménopiles regroupent les algues brunes - dont les kelp, jusqu'a 60 m de long - e les diatomées unicellulaires).
* La division entre Procaryotes e Eucaryotes es abandonnée, au profit de la division en trois du vivant.
*L'application de cette classificacion aux angiospermes es illustrée per la [[classificacion APG]] de l'angiosperms phylogeny group.
 
== A legir ==
 
''[[Classificacion filogenetica del vivent]]'' / [[Guillaume Lecointre]] e [[Hervé Le Guyader]]. -Paris : [[Belin]], 2001. - ISBN 2-7011-2137-X.
 
==Vèire tanben==
 
*[[arbre filogenetic]]
*[[filologenia]]
 
== Ligams extèrnes ==
 
* [http://www.treebase.org/treebase/index.html Treebase]
* [http://tolweb.org/tree/phylogeny.html Projet Tree of Life]
 
{{Taxinomia}}
{{Biologia|brancas}}
 
[[Categoria:Classificacion scientifica]]
[[categoria:filogenetica]]
 
[[da:Domæne (biologi)]] [[de:Phylogenetischer_Baum]] [[en:Phylogenetic_tree]] [[es:Dominio (biología)]] [[nl:Domein (biologie)]] [[pl:Domena (biologia)]] [[pt:Super reino]] [[sv:Domän (biologi)]] [[vi:C%C3%A2y_ph%C3%A1t_sinh_ch%E1%BB%A7ng_lo%E1%BA%A1i]][[zh:域 (生物)]]
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